วันที่ 5 มกราคม 2560 มหาวิทยาลัยมหิดล เข้าร่วมการจัดอันดับมหาวิทยาลัยสีเขียวของโลก จากมหาวิทยาลัยที่เข้าร่วมจัดอันดับทั้งสิ้น 516 แห่งทั่วโลก ผลปรากฏว่า มหาวิทยาลัยมหิดล ติดอันดับ 1 ใน 100 มหาวิทยาลัยสีเขียวระดับโลก โดยได้อันดับที่ 70 ของโลก และเป็นอันดับที่ 1 จาก 22 มหาวิทยาลัยในประเทศไทย
จากผลการสำรวจของ UI Green Metric World University Ranking 2016 ซึ่งจัดทำโดย University of Indonesia มหาวิทยาลัยในอินโดนีเซีย (UI) เมื่อวันที่ 29 ธันวาคม 2559 ได้ประกาศให้ มหาวิทยาลัยมหิดล เป็นสถาบันการศึกษาสีเขียวที่เป็นมิตรกับสิ่งแวดล้อมเป็นอันดับที่ 70 ของโลก และถือเป็นอันดับที่ 1 ของประเทศไทย จากจำนวนมหาวิทยาลัยที่เข้าร่วมการจัดอันดับรวมทั้งสิ้นจำนวน 516 แห่งทั่วโลก โดยได้คะแนนรวมที่ 5,992 คะแนน จากเกณฑ์การประเมิน 6 ด้าน ดังนี้
1.การวางระบบโครงสร้างพื้นฐาน
2. การจัดการพลังงงานและการเปลี่ยนแปลงสภาพภูมิอากาศ
3. การจัดการของเสีย
4. การจัดการน้ำ
5. การสัญจร
6. การศึกษา
โดย “สุดยอดมหาวิทยาลัยสีเขียว” ของโลกประจำปี 2016 จากผลสำรวจในครั้งนี้ ได้แก่ มหาวิทยาลัยแคลิฟอร์เนีย เดวิส (University of California Davis) ประเทศสหรัฐอเมริกา ซึ่งได้รับคะแนนจากการประเมินทั้ง 6 ด้านที่ 8,398 คะแนน
